文章目录

摘要

ABSTRACT

英文缩略词对照表

第一章 前言

1.1 生殖道微生物群落

1.2 HPV与生殖道健康

1.3 生殖道微生物人群差异

1.4 本研究的意义和目的

第二章 方法与材料

2.1 研究对象

    2.1.1 纳入标准

    2.1.2 排除标准

2.2 资料采集

    2.2.1 病史采集

    2.2.2 一般检查采集

    2.2.3 标本采集

2.3 实验方法

    2.3.1 HPV基因型测定

    2.3.2 DNA的提取

    2.3.3 DNA质量检测

    2.3.4 PCR扩增和Illumina MiSeq测序

2.4 统计方法

    2.4.1 SPSS统计

    2.4.2 序列分析和统计

第三章 结果

3.1 人群一般资料分析

3.2 云南迪庆州藏族妇女宫颈、阴道HPV感染情况及基因型型别

3.3 云南迪庆州藏族女性生殖道中微生物的序列信息和多样性指数分析

3.4 生殖道中微生物群落多样性分析

3.5 PCoA分析

3.6 HPV感染与生殖道微生物相关性

第四章 讨论

4.1 HPV感染及影响

4.2 生殖道菌群结构及改变

4.3 HPV感染与相关微生物

第五章 结论

第六章 不足与展望

参考文献

综述 生殖道微生物与宫颈癌相关性研究进展

参考文献

致谢

文章摘要:目的:初步明确云南迪庆州藏族妇女生殖道感染人乳头瘤病毒（Human papilloma virus,HPV）的状况与HPV基因型;通过对宫颈及阴道微生物测序结果分析初步了解迪庆州藏族妇女生殖道中微生物的结构与组成;探索生殖道中微生物与HPV感染的相关性。对象与方法:收集2020年9月迪庆州藏族自治州人民医院自愿加入该研究的云南省迪庆州妇女,进行基本信息采集（包括身高、体重、年龄等）;并取宫颈拭子、阴道拭子拭子各三份,选取其中藏族病例,按照纳入、排除标准选取合适病例。对选取病例采集的标本分别行HPV基因型检测,提取标本的基因组的DNA,使用细菌的16s rRNA基因通用引物对提取的DNA进行扩增,使用Illumina Miseq高通量测序,对所取标本中的细菌群落结构进行分析。分析方法:（1）采用SPSS 26.0软件进行数据分析。计量资料用（±s）表示,组间比较采用独立样本t检验;计数资料用n（%）表示,组间比较采用卡方检验或Fisher精确检验;P＜0.05表示有统计学意义。（2）对测序返回的数据进行分析,根据MiSeq SOP即Mothur v1.42.0^[1]的的软件包进行序列处理,数据库序列和分类信息来源为SILVA SSURef database v132^[2]。对比序列相似度,选择相似度≥97%划分可操作分类单元（Operational taxonomic units,OTU）,依次计算各个标本的Alpha多样性指数。选择丰度较高并且具有代表性的OTU进行分析,计算所有样品序列的距离矩阵和聚类,并基于该计算结果进行主坐标分析（Principal coordinate analysis,PCoA）,选择丰度较高且更具有代表性的OUT进行对比分析。结果:最终藏族妇女病例数共有39例,其中HPV+（宫颈HPV感染阳性者）16例占总人数的41.03%,HPV-（宫颈HPV感染阴性者）23例占总人数的58.97%。将病例按照宫颈HPV感染情况分为HPV+及HPV-两组后对人群一般资料分析,发现HPV+与HPV-各指标的组间比较便秘、体重及体重指数（Body mass index,BMI）差异有统计学意义,即可以认为便秘在HPV+与HPV-两组的发生率不同阳性组明显低于阴性组;HPV+的体重、BMI明显低于HPV-。藏族妇女HPV感染的基因型均包括16型,其中有1例病例为多基因型感染,基因型为16、18、51、67型,其余均为单基因型感染,型别均为16型。同时也检测了阴道HPV感染的情况及基因型,阴道HPV+者9例,阴道HPV-者30例,宫颈及阴道感染HPV的基因型与感染病例之间不完全重叠。生殖道微生物多样性指数分析发现,HPV+病例的宫颈微生物与HPV+及HPV-病例阴道微生之间均存在着显著差异。对生殖道中的微生物群落进行多样性分析发现HPV+病例的宫颈微生物群落丰度与阴道微生物群落及HPV-病例宫颈微生物群落丰度有明显区别。PCoA分析中HPV+及HPV-病例的阴道及宫颈标本的微生物构成无显著差异。进行LEfSe分析提示生殖道不同部位标本在在HPV感染的不同情况下存在微生物群落丰度有差异的。

文章关键词:

论文DOI:10.27811/d.cnki.gdixy.2022.000220

论文分类号:R711.32